用醫師的視角，透過華雲的一生經歷，展現出三國時期的歷史、政治與文化。
三國，一個亂世爭雄的年代，伴隨戰爭的洗禮，各種災情突如其來，各色人物輪番上陣。英雄，並不是只有衝鋒陷陣、統帥全軍、指點江山、統一天下之人才能成為英雄，能承受千辛之磨難、歷經磨難並能克服之人也能稱為英雄。
公元一九三年，兗州牧曹操為父報仇，血染徐州，華佗之徒阿妹臨死產下一子，被華佗收為徒弟，取名華雲。
一個無父無母的孩子將如何在亂世中存活？華雲的一生究竟是幸還是不幸？
前半生，他被華佗一手撫養長大，然而華佗卻被曹操所殺。華雲該如何面對這一切？
後半生，他是為報養育之恩而復仇，還是放棄復仇，為繼承甚至超越師傅而努力奮鬥？
當曹操終是成為歷史的洪流，華雲又該何去何從？
他會被那個時代所陶汰，還是會衝破阻礙終以形成大器？一切盡在《三國醫師傳》。